L’histoire commence lorsque deux créatures divines mènent un combat avec acharnement juste au dessus de la ville de Tokyo. La forte intensité de leur lutte créa un pilier obscur sur Terre qui inspira un sentiment de peur et de confusion chez les habitants. Les scientifiques chargés d’étudier cette colonne, Joe et Marie Hayakawa, se mirent à faire des recherches et écrivirent un livre sur ce mystérieux pilier. Après l’avoir rédigé, ils décidèrent d’explorer le « pilier obscur » et ne revinrent jamais de ce voyage périlleux…
12 ans plus tard les enfants des scientifiques partirent a la recherche de leurs parents.